Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATP5EP56381 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms