Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP1P56182 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP1P56182 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1P56182 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms