Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SUMO3P55854 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms