Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLURP1P55000 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms