Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRAP54198 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRAP54198 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRAP54198 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRAP54198 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRAP54198 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms