Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NKX2-5P52952 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms