Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP2P52943 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP2P52943 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms