Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A2P52657 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms