Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTDSS1P48651 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms