Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms