Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGAEP38570 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms