Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTBRP36941 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBRP36941 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBRP36941 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBRP36941 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms