Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms