Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH11P35749 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH11P35749 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH11P35749 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH11P35749 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH11P35749 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYH11P35749 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms