Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms