Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms