Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO2P25791 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMO2P25791 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMO2P25791 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO2P25791 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMO2P25791 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMO2P25791 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMO2P25791 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMO2P25791 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMO2P25791 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMO2P25791 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMO2P25791 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms