Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms