Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms