Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCEA1P23193 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA1P23193 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms