Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKACGP22612 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms