Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASTP20810 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASTP20810 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASTP20810 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASTP20810 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASTP20810 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASTP20810 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASTP20810 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms