Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTF3P20783 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTF3P20783 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTF3P20783 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTF3P20783 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTF3P20783 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NTF3P20783 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms