Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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