Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF3P18847 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF3P18847 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms