Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRB1P17538 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRB1P17538 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms