Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms