Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFAP15692 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms