Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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