Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLUP10909 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLUP10909 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLUP10909 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLUP10909 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLUP10909 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLUP10909 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLUP10909 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLUP10909 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLUP10909 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms