Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIL1P09327 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIL1P09327 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms