Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC1P02654 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOC1P02654 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC1P02654 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC1P02654 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms