Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOMM40O96008 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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