Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX7O95931 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX7O95931 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms