Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNMDO75829 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNMDO75829 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNMDO75829 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNMDO75829 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNMDO75829 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNMDO75829 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNMDO75829 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNMDO75829 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNMDO75829 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNMDO75829 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNMDO75829 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNMDO75829 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNMDO75829 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNMDO75829 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms