Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NBNO60934 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NBNO60934 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NBNO60934 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NBNO60934 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NBNO60934 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NBNO60934 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBNO60934 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBNO60934 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBNO60934 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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