Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMFO60524 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMFO60524 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms