Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms