Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREB3O43889 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREB3O43889 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms