Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPRY3O43610 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRY3O43610 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms