Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms