Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUX2O14529 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CUX2O14529 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CUX2O14529 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CUX2O14529 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUX2O14529 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUX2O14529 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUX2O14529 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms