Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F3O00716 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F3O00716 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F3O00716 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F3O00716 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F3O00716 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F3O00716 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms