Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
J3KT08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms