Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCER2I3L3R5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms