Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CROCC2H7BZ55 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms