Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRRM3A6NNA2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRM3A6NNA2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms