Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCNX2A6NKB5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PCNX2A6NKB5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCNX2A6NKB5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCNX2A6NKB5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms