Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms