Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms